1 #ifndef STAN_MATH_PRIM_MAT_FUN_COV_MATRIX_FREE_LKJ_HPP
2 #define STAN_MATH_PRIM_MAT_FUN_COV_MATRIX_FREE_LKJ_HPP
31 Eigen::Matrix<T, Eigen::Dynamic, 1>
33 const Eigen::Matrix<T, Eigen::Dynamic, Eigen::Dynamic>& y) {
40 size_type k = y.rows();
45 size_type k_choose_2 = (k * (k-1)) / 2;
46 Array<T, Dynamic, 1> cpcs(k_choose_2);
47 Array<T, Dynamic, 1> sds(k);
50 throw std::runtime_error(
"factor_cov_matrix failed on y");
51 Matrix<T, Dynamic, 1> x(k_choose_2 + k);
53 for (size_type i = 0; i < k_choose_2; ++i)
55 for (size_type i = 0; i < k; ++i)
Eigen::Matrix< double, Eigen::Dynamic, Eigen::Dynamic >::Index size_type
Type for sizes and indexes in an Eigen matrix with double e.
Primary template class for the metaprogram to compute the index type of a container.
bool factor_cov_matrix(const Eigen::Matrix< T, Eigen::Dynamic, Eigen::Dynamic > &Sigma, Eigen::Array< T, Eigen::Dynamic, 1 > &CPCs, Eigen::Array< T, Eigen::Dynamic, 1 > &sds)
This function is intended to make starting values, given a covariance matrix Sigma.
Eigen::Matrix< T, Eigen::Dynamic, 1 > cov_matrix_free_lkj(const Eigen::Matrix< T, Eigen::Dynamic, Eigen::Dynamic > &y)
Return the vector of unconstrained partial correlations and deviations that transform to the specifie...
void domain_error(const char *function, const char *name, const T &y, const char *msg1, const char *msg2)
Throw a domain error with a consistently formatted message.